Эмнелерди билүү керек
- Айрым PDB файлдары программа базасынын файлдары.
- Текст редактору же Geneious сыяктуу программа менен ачыңыз.
- Белгиленген базаңыздын файлын ачкан программа менен башка форматка айландырыңыз.
Бул макалада PDB файлы деген эмне, аны кантип ачуу жана башка форматка кантип айландыруу керектиги түшүндүрүлөт.
PDB файлы деген эмне?
PDB файл кеңейтүүсү бар файл, кыязы, DLL же EXE файлы сыяктуу программа же модул жөнүндө мүчүлүштүктөрдү оңдоо маалыматын сактоо үчүн колдонулган программа базасынын файлы. Алар кээде символдук файлдар деп аталат.
Файл баштапкы коддогу ар кандай компоненттерди жана билдирүүлөрдү өзүнүн акыркы компиляцияланган продуктусуна түшүрөт, аны мүчүлүштүктөрдү оңдоочу баштапкы файлды жана мүчүлүштүктөрдү оңдоо процессин токтотууга тийиш болгон аткарылуучу файлдан жайгашкан жерди табуу үчүн колдоно алат.
Айрым PDB файлдары анын ордуна Протеин маалыматтар банкынын файл форматында болушу мүмкүн. Булар белок структураларына тиешелүү координаттарды сактаган жөнөкөй текст файлдары.
Башка PDB файлдары Palm Database же PalmDOC файл форматында түзүлүп, PalmOS мобилдик операциялык системасы менен колдонулушу мүмкүн; бул форматтагы кээ бир файлдар анын ордуна. PRC файл кеңейтүүсүн колдонушат. Ушул эле кеңейтүүнү колдонгон дагы бир формат - Tanida Demo Builder.
PDB файлын кантип ачуу керек
Ар кандай программалар структураланган маалымат базасынын форматында маалыматтарды сактоо үчүн өздөрүнүн PDB файлын колдонушат, андыктан ар бир колдонмо өзүнүн түрүн ачуу үчүн колдонулат.
Geneious, Quicken, Visual Studio жана Pegasus бул файлды маалымат базасы файлы катары колдоно турган программалардын бир нече мисалдары. Radare жана PDBparse да иштеши мүмкүн.
Кээ бир PDB файлдары Geneious' Программа Debug Database файлдары сыяктуу жөнөкөй текст катары сакталат жана текст редакторунда ачылса, адам окуй алат. Сиз PDB файлынын мындай түрүн тексттик документтерди окуй алган каалаган программа менен ача аласыз, мисалы Windows'тун орнотулган Notepad программасы. Кээ бир башка шайкеш көрүүчүлөр жана редакторлор Notepad++ жана кашааларды камтыйт.
Башка PDB файлдары тексттик документтер эмес жана алар арналган программа менен ачылганда гана пайдалуу. Мисалы, сиздики Quicken менен кандайдыр бир байланышта болсо, анда аны көрүү же түзөтүү үчүн ошол программаны колдонуп көрүңүз. Visual Studio PDB файлын DLL же EXE файлы менен бир папкада көрүүнү күтөт.
Сиз Avogadro менен Windows, Linux жана macOS'то Protein Data Bank файлдарын көрүп жана түзөтө аласыз. Бул программалар файлды да ача алат: Jmol, RasMol, QuickPDB жана USCF Chimera. Булар жөнөкөй текст болгондуктан, сиз аны текст редакторунда да ачсаңыз болот.
Palm Desktop бул файлды ача алышы керек, эгерде ал Palm Database файл форматында болсо, бирок аны таануу үчүн ал программа үчүн PRC файл кеңейтүүсү болушу үчүн алгач анын атын өзгөртүүгө туура келиши мүмкүн. Калибр - башка вариант.
PalmDOC PDB файлын ачуу үчүн STDU Viewer программасын колдонуп көрүңүз.
Tanida Demo Builder файлдарды ошол форматта ачат.
PDB файлын кантип айландыруу керек
Программа маалымат базасынын файлдары жок дегенде кадимки файлды конвертер куралы менен башка файл форматына айландырылышы мүмкүн эмес. Анын ордуна, файлдын ушундай түрүн конвертациялай турган кандайдыр бир колдонмо бар болсо, аны ача турган ошол эле программа болмок.
Мисалы, эгер сиз Quicken'ден маалымат базаңыздын файлын айландырышыңыз керек болсо, аны аткаруу үчүн ошол программаны колдонуп көрүңүз. Бирок конверсиянын бул түрү аз гана эмес, балким, бул маалымат базасы колдонмолорунда да колдоого алынбайт (б.а., бул түрдөгү PDB файлын башка форматка которуунун кереги жок окшойт).
Protein Data Bank файлдарын MeshLab менен башка форматтарга айландырса болот. Бул үчүн, адегенде Файл > Сүрөттү төмөнкүчө сактоо > VRML ичинен PyMOL менен WRL форматына айландырышыңыз керек болот. менюну, андан кийин WRL файлын MeshLab'ке импорттоо жана PDB файлын акырында төмөнкүгө айландыруу үчүн Файл > Менюсун колдонуңуз. STL же башка файл форматы.
Эгер сизге моделдин түстүү болушунун кереги жок болсо, файлды USCF Chimera менен STLге түз экспорттой аласыз (жүктөп алуу шилтемеси жогоруда). Болбосо, жогорудагыдай эле ыкманы (MeshLab менен) колдонуп, PDBди USCF Chimera менен WRLге конверттеп, андан кийин WRLди MeshLab менен STLге экспорттосоңуз болот.
PDBди PDF же EPUB форматына айландыруу үчүн, эгер сизде PalmDOC файлы бар болсо, бир нече жол менен мүмкүн, бирок эң оңой жолу - Zamzar сыяктуу онлайн конвертер колдонуу. Файлыңызды ошол веб-сайтка жүктөй аласыз жана аны ошол форматтарга, ошондой эле AZW3, FB2, MOBI, PML, PRC, TXT жана башка электрондук китеп файл форматтарына айландыра аласыз.
Бирин FASTA форматына айландыруу үчүн Meiler Lab онлайн PDB to FASTA конвертери менен жасалса болот.
Бул файлды PDBx/mmCIF аркылуу CIF (кристаллографиялык маалымат форматы) онлайн режиминде сактаса да болот.
Дагы эле ача албай жатасызбы?
Жогорудагы куралдардын бири менен ачылбаган файлдар чындыгында PDB файлдары эмес. Сиз файл кеңейтүүсүн туура эмес окуп жатасыз деп эмне болушу мүмкүн; кээ бир форматтар PDBга окшош суффикс колдонушат, алар чындап эле бири-бирине тиешеси жок жана бирдей иштебейт.
Мисалы, PDF файлы бул документ файлы, бирок жогорудагы программалардын көбү текстти жана/же сүрөттөрдү ушул программалык камсыздоо программалары менен ачууга аракет кылсаңыз, туура көрсөтпөйт. DBF, DB, ADP, PD, PDE, PDC, PDO жана WPD файлдары сыяктуу жазылышы окшош файл кеңейтүүлөрү бар башка файлдар үчүн да ушундай.
PBD EaseUS Todo Backup программасына таандык башка программа жана ошол программа менен ачылганда гана пайдалуу.
Эгер сизде PDB файлы жок болсо, аны ача турган же конверттеген ылайыктуу программаны табуу үчүн файлыңызда бар файл кеңейтүүсүн изилдеңиз.
PDB файлдарында өркүндөтүлгөн окуу
Сиз GitHub жана Wintellect'тен программа базасынын файлдары жөнүндө көбүрөөк окуй аласыз.
Протеин маалыматтар банкынын файлдары жөнүндө дагы билүүгө болот; караңыз Worldwide Protein Data Bank and RCSB PDB.
Көп берилүүчү суроолор
- Visual Studio PDB файлдарын таба албай же ача албаса, аны кантип оңдойм? Эгер Visual Studio PDB файлын таба албайт же ача албайт деген билдирүүнү көрсөңүз, аракет кылып көрүңүз. Visual Studio'нун мүчүлүштүктөрдү оңдоо куралын колдонуу. Tools > Options > Debugging > Symbols жана Microsoft Symbol Servers тандаңыз
- Мен Androidде PDB файлын кантип ачам? Androidде PDB файлын ачуу үчүн үчүнчү тараптын файл окугучун колдонуңуз. Google Play'ден Cool Reader колдонмосун же башка PDB файлы колдоого алынган окурманды жүктөп алыңыз.