Эмнелерди билүү керек
- FNA файлы - FASTA форматындагы ДНК жана протеиндердин ырааттуулугун тегиздөө файлы.
- Geneious менен ачыңыз.
- Ошол эле программа менен FASTA жана окшош форматтарга айландырыңыз.
Бул макалада FNA файлы деген эмне, аны кантип ачуу жана FASTA, GB, VCF, сүрөттөр ж.б. сыяктуу башка форматка кантип сактоо керектиги түшүндүрүлөт.
FNA файлы деген эмне?
FNA файл кеңейтүүсү бар файл - бул молекулярдык биология программасы тарабынан колдонула турган ДНК маалыматын сактаган FASTA Формат ДНК жана Протеин ырааттуулугун тегиздөө файлы.
FNA файлдары, өзгөчө, жөн гана нуклеин кислотасынын маалыматын сактоо үчүн колдонулушу мүмкүн, ал эми башка FASTA форматтары FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ сыяктуу ДНКга тиешелүү маалыматты камтыйт., NET же AA файл кеңейтүүлөрү.
Бул текстке негизделген FASTA форматтары алгач ушундай аталыштагы программалык пакеттен пайда болгон, бирок азыр ДНК жана белок ырааттуулугун тегиздөө колдонмолорунда стандарт катары колдонулат.
FNA ошондой эле бул файл форматына эч кандай тиешеси жок кээ бир технологиялык терминдерди билдирет, мисалы, акыркы тармакты кабыл алуу, файлдын аталышын/атрибуттарын көбөйтүү каражаты, Fujitsu тармагынын архитектурасы жана тез кошуна жарнак.
FNA файлын кантип ачуу керек
Бирөөнү Windows, macOS жана Linux'та Geneious менен ачыңыз (ал 14 күн акысыз). Бул үчүн Файл > Импорттоо менюсуна өтүп, файлды Файлдан аркылуу импорттоону тандаңыз.меню нерсеси.
Сиз BLAST Ring Image Generator (BRIG) менен да ача аласыз.
Эгер ал идеялар ишке ашпай жатса, Notepad++ же башка текст редакторун колдонуп көрүңүз. Файл чындап эле текстке негизделген жана окуу үчүн жөнөкөй болушу мүмкүн же анын FASTA форматына эч кандай тиешеси жок экенин байкасаңыз болот, бул учурда файлды тексттик документ катары ачуу файлды түзүү үчүн колдонулган нерсени аныктаган текстти ачып бериши мүмкүн. же файл кандай форматта.
FNA файлын кантип айландырса болот
Биз муну текшере албайбыз, анткени биз аны сынап көрө элекпиз, бирок сиз файлды FASTA, GB, GENEIOUS, MEG, ACE, CSV, NEX, PHY, SAM, TSV жана VCF. Муну программанын Файл > Экспорт менюсу аркылуу кылса болот.
Ошол эле программа файлды PNG, JPG, EPS же PDF форматына Файл > Сүрөт файлы катары сактоо аркылуу сактай алат..
Адатта файлдын кеңейтилишинин атын башка нерсеге өзгөртүп, анын ушундай иштешин күтө албасаңыз да, эгер сиздин өзгөчө ДНК секвенирлөөчү программаңыз тааный турган болсо,. FNA файлынын атын. FA файлына өзгөртсөңүз болот. FA форматы.
Файл кеңейтүүлөрүн атын өзгөртүүнүн ордуна, сиз башка файл түрлөрүн конвертациялоо үчүн акысыз файл конверторун колдонгуңуз келет. FNA жана FA файлдарында, кээ бир программалар FA файл кеңейтүүсү бар файлдарды гана ача тургандай болот, мындай учурда анын атын өзгөртүү жакшы иштеши керек.
Дагы эле ача албай жатасызбы?
Эгер жогорудагы программаларды колдонгондон кийин дагы эле файлыңызды ача албай жатсаңыз, анда файл кеңейтүүсү. FNAны окубай турганын, анын ордуна жөн эле окшош бир нерсени байкашыңыз мүмкүн.
Мисалы, FNG (Font Navigator Group) файлдары ". FNA" деп айткандай абдан коркунучтуу көрүнөт, бирок жакшылап карасаңыз, биринчи эки тамга гана бирдей. Файл кеңейтүүлөрү ар башка болгондуктан, бул алардын файл форматы башка экенин жана бир эле программалар менен иштебей калышы мүмкүн экенин көрсөтүп турат.
ФАКС, FAS (Түзүлгөн тез жүктөөчү AutoLISP), FAT, FNTA (Aleph One шрифти), FNC (Vue функциялары) жана FND (Windows Saved Search) сыяктуу башка көптөгөн файл кеңейтүүлөрү үчүн да ушуну айтууга болот.
Бул жердеги идея жөн гана файл кеңейтүүсү. FNA окуй турганына ынануу. Эгер ошондой болсо, аны ачуу же айландыруу үчүн жогорудагы программаларды колдонуп көрүңүз. Эгер сизде файлдын башка түрү болсо, аны ачуу же конвертациялоо үчүн кайсы колдонмолор керек экенин билүү үчүн анын кеңейтүүсүн изилдеңиз.
КБС
Pythonдо FNA файлын кантип ачасыз?
Биринчиден, Geneious сыяктуу үчүнчү тарап тиркемесин колдонуп, FNA файлын FASTA форматына айландырыңыз. Андан кийин, сиз Biopython, биоинформатикада иштөө үчүн биологиялык эсептөө үчүн эркин жеткиликтүү куралдар топтомун жүктөп алсаңыз болот. Акырында, FASTA файлдары менен иштөө боюнча нускамаларды алуу үчүн Biopython үйрөткүчүнө жана тамак китебине кайрылыңыз.
Ancestry raw файлынан FNA жасоочу номерлерди кантип тапсам болот?
Сиз ДНК маалыматтарынын көбүн Ancestry.com сайтынан.txt форматында жүктөп алсаңыз болот. Бирок, ДНКсы кийинки муундагы секвенирлөө (NGS) менен анализденген кардарлар гана VCF файлын жүктөө мүмкүнчүлүгүнө ээ. VCF файлын жүктөп алуу үчүн сиз ДНКнын ээси болушуңуз керек, ДНК NGS технологиясы менен текшерилген жана түзмөгүңүздө кеминде 350 МБ бош орун болушу керек.
